Morales comenzó su carrera en Rosario Central, donde se formó como futbolista. Años mas tarde pasó por Atlético Rafaela, desde el 2015 hasta el 2017, donde disputó 29 encuentros, y concretó 2 goles. Boca Unidos se interesó en el volante y lo fichó. Allí disputó, con el club correntino, la última temporada del Torneo Federal A, jugando 19 partidos y convirtiendo 7 tantos.
El "Cervecero" puso sus ojos en el jugador categoría '94 y comenzó negociaciones, con el, para reforzar el plantel profesional. Aunque ya existía un acuerdo de palabra y solamente restaba la firma, el pase se cayó. Los representantes del futbolista buscaban firmar un contrato por un año y medio, mientras que desde la dirigencia de Quilmes pretendían un acuerdo contractual de dos años y medio, justificando que si el jugador tenia un buen año futbolístico partiría como jugador libre y no en una venta realizada por la institución.